Прокуратурата сама е обрекла на провал разкриването на аферата с източването на милиони левове от програма САПАРД. Обвинението оттегли и протеста си срещу оправдателната присъда по делото за пране на пари срещу Марио Николов и Людмил Стойков. В следващите дни се очаква прокуратурата да "изтегли" протеста и срещу останалите подсъдими и да поиска от Върховния касационен съд (ВКС) делото да бъде върнато в досъдебното производство. Това обяви изпълняващия функциите главен прокурор Бойко Найденов. С този акт двамата са обявени за окончателно невинни по повдигнатите им обвинения. Процесът бе силно политизиран още в самото си началото и бе следен под лупа от Европейската комисия "За мен буди недоумение защо прокурор Ненков е постъпил по този начин. По всичката логика на света и по моята Върховният касационен съд трябва да се произнесе за присъдата по САПАРД", обяви днес Бойко Найденов. Прокурор Стойчо Ненков оттеглил протеста срещу оправдаването на Марио Николов и Людмил Стойков, но го поддържа по отношение на останалите четирима подсъдими. Това действие на прокурора по едно от делата, наблюдавани внимателно от Европейската комисия показва, че прокуратурата сама признава допуснатите грешки при воденето на делото. Поведението на прокурор Ненков предизвика спешна реакция от изпълняващия функциите на главен прокурор Бойко Найденов, който на извънредна пресконференция заяви, че след като е разбрал за случилото се е разпоредил да започне дисциплинарна проверка на прокурор Ненков. Ако делото бъде върнато на фаза разследване, прокуратурата ще може да реагира и да поправи обвинението по аферата "САПАРД". На 21 септември Софийски Апелативен съд оправда бизнесмените Марио Николов и Людмил Стойков. Мотивите: Обвинението разделило без ясна причина разследването на две - за присвояване на 7,5 млн. евро от програмата и за пране на пари. И второ - повдигнала обвинения по неясен принцип не на всички, за които имало данни, че са вършили престъпления. Отмяната на осъдителната присъда по делото за пране на пари е втори удар за прокуратурата по аферата "САПАРД". През 2010 г. Софийският градски съд осъди Марио Николов на 12 години за източване на субсидии и прати за по 5 години зад решетките по същото обвинение още петима. Тогава бяха оправдани единствено Петя Хаджииванова и Радмил Петров. През юли тази година друг състав на апелативния съд отмени тази присъда, обяви я за неграмотно мотивирана и върна делото на прокуратурата.
